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磁珠富集法开发毛竹SSR标记引物

彭镇华 刘贯水 李潞滨

引用本文:
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磁珠富集法开发毛竹SSR标记引物

  • 基金项目:

    林业公益性行业科研专项(No. 200704001);国家林业局重点项目(No.2007-01);"十一·五"科技支撑(2006BAD19B08)

  • 中图分类号: Q346.5

Development of Polymorphic Simple Sequence Repeats Markers in Phyllostachys edulis by Magnesphere

  • CLC number: Q346.5

  • 摘要: 用磁珠富集法筛选毛竹基因组DNA的SSR分子标记,利用磁珠法对毛竹基因组DNA的AFLP片段进行了富集,分别构建了富含GT、AG、CCA重复基元的富集文库,利用克隆PCR法对文库进行筛选,检测菌落数分别为1080、620、630个,阳性菌落中含目的重复的序列分别为137、73、41个,富集效率分别为12.7%、11.8%、6.5%。双碱基重复的富集效率高于三碱基富集效率。根据获得的序列结果,设计了53对SSR引物,其中31对引物在毛竹中成功扩增出目的大小的条带,扩增成功率为58.9%。
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出版历程
  • 收稿日期:  2010-06-30
  • 刊出日期:  2011-12-13

磁珠富集法开发毛竹SSR标记引物

  • 1. 国际竹藤网络中心,北京 100102
  • 2. 中国林业科学研究院林业研究所,国家林业局林木培育重点实验室,北京 100091
基金项目:  林业公益性行业科研专项(No. 200704001);国家林业局重点项目(No.2007-01);"十一·五"科技支撑(2006BAD19B08)

摘要: 用磁珠富集法筛选毛竹基因组DNA的SSR分子标记,利用磁珠法对毛竹基因组DNA的AFLP片段进行了富集,分别构建了富含GT、AG、CCA重复基元的富集文库,利用克隆PCR法对文库进行筛选,检测菌落数分别为1080、620、630个,阳性菌落中含目的重复的序列分别为137、73、41个,富集效率分别为12.7%、11.8%、6.5%。双碱基重复的富集效率高于三碱基富集效率。根据获得的序列结果,设计了53对SSR引物,其中31对引物在毛竹中成功扩增出目的大小的条带,扩增成功率为58.9%。

English Abstract

参考文献 (16)

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