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杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

刘攀峰 杜红岩 乌云塔娜 杜兰英 孙志强

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杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

  • 基金项目:

    国家公益性行业科研专项(201004029)

  • 中图分类号: S718.4

Cloning and Sequence Analysis of 1-Hydroxy-2-Methyl-2-E-Butenyl-4-Diphosphate Reductase Gene cDNA from Eucommia ulmoides

  • CLC number: S718.4

  • 摘要: 以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出HDR基因的cDNA克隆,命名为EuHDR。EuHDR基因cDNA全长1 653 bp,5’端非编码区长82 bp,3’端非编码区长188 bp,编码460个氨基酸,与喜树HDR基因序列相似性最高,达82%;推导EuHDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A33)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A117,A208,A262,A345);EuHDR蛋白二级结构α-螺旋占35.65%,β-折叠占19.78%,螺环结构占44.57%;EuHDR蛋白三级结构为单体形式,呈不规则的三叶草形状;系统进化分析表明EuHDR蛋白与葡萄HDR蛋白的亲缘关系最为接近。
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-08-28

杜仲HDR基因全长cDNA克隆与序列分析

  • 1. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 河南 郑州 450003
  • 2. 国家林业局经济林育种与栽培重点实验室, 湖南 长沙 410004
基金项目:  国家公益性行业科研专项(201004029)

摘要: 以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出HDR基因的cDNA克隆,命名为EuHDR。EuHDR基因cDNA全长1 653 bp,5’端非编码区长82 bp,3’端非编码区长188 bp,编码460个氨基酸,与喜树HDR基因序列相似性最高,达82%;推导EuHDR氨基酸序列中包含转运肽序列(A1-A33)及植物HDR蛋白多个保守的功能位点(A117,A208,A262,A345);EuHDR蛋白二级结构α-螺旋占35.65%,β-折叠占19.78%,螺环结构占44.57%;EuHDR蛋白三级结构为单体形式,呈不规则的三叶草形状;系统进化分析表明EuHDR蛋白与葡萄HDR蛋白的亲缘关系最为接近。

English Abstract

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