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基于cpDNA rps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系

莫文娟 李少锋 邱乾栋 孙长忠 汤志敏 乔杰 杜红岩 傅建敏

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基于cpDNA rps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系

  • 基金项目:

    十二五科技支撑"抗逆生态树种泡桐新品种选育技术研究"(2012BAD01B0602)

  • 中图分类号: S792.43

Genetic Relationships among Paulownia elongata, Paulownia fortunei and Paulownia tomentosa Based on cpDNA rps16 Region Sequences

  • CLC number: S792.43

  • 摘要: [目的] 通过测序法分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐在叶绿体rps16序列上的遗传差异,旨在分析三者之间在叶绿体基因上的变化特点和规律,探讨其种间的遗传关系。[方法] 选取兰考泡桐、白花泡桐和毛泡桐各15个样本,对其提取的DNA用PCR扩增获得特异片段,并将其纯化与测序。利用软件Clustal X 2.0对所得序列进行排序;运行MEGA 4软件,进行多序列比对,分析其序列特征,并计算出K2P遗传距离。[结果] (1)对获得的rps16序列进行测定分析,得兰考泡桐序列长度分别为932~933 bp;白花泡桐序列长度为932 bp;毛泡桐序列长度分别为916~918 bp。对所得rps16序列进行排序后的长度为938 bp,平均GC含量为34.31%。3个种所代表的个体之间共有10个变异位点,占整个序列长度的1.07%。其中有9个变异位点属于碱基插入或缺失类型,占变异位点总数的90%,占整个序列长度的0.96%。有1个变异位点属于碱基替换类型,占整个变异位点总数的10%,占整个序列长度的0.11%。(2)整个rps16片段的序列共有10个变异位点,其中兰考泡桐与白花泡桐在总的变异位点上,具有一致的碱基位点9个,占总变异的90%。而兰考泡桐与毛泡桐相比,没有相同的碱基。[结论] 根据三种泡桐的rps16序列的序列特征和变异位点的分析,表明在叶绿体遗传方面,兰考泡桐具有与白花泡桐更多相似的遗传物质,其亲缘关系较近。综上所述,推测兰考泡桐与白花泡桐可能来自同一母系遗传。
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出版历程
  • 收稿日期:  2015-05-23

基于cpDNA rps16序列分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐的遗传关系

  • 1. 中国林业科学研究院华北林业实验中心, 北京 102300
  • 2. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 河南 郑州 450003
  • 3. 北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083
基金项目:  十二五科技支撑"抗逆生态树种泡桐新品种选育技术研究"(2012BAD01B0602)

摘要: [目的] 通过测序法分析兰考泡桐与白花泡桐和毛泡桐在叶绿体rps16序列上的遗传差异,旨在分析三者之间在叶绿体基因上的变化特点和规律,探讨其种间的遗传关系。[方法] 选取兰考泡桐、白花泡桐和毛泡桐各15个样本,对其提取的DNA用PCR扩增获得特异片段,并将其纯化与测序。利用软件Clustal X 2.0对所得序列进行排序;运行MEGA 4软件,进行多序列比对,分析其序列特征,并计算出K2P遗传距离。[结果] (1)对获得的rps16序列进行测定分析,得兰考泡桐序列长度分别为932~933 bp;白花泡桐序列长度为932 bp;毛泡桐序列长度分别为916~918 bp。对所得rps16序列进行排序后的长度为938 bp,平均GC含量为34.31%。3个种所代表的个体之间共有10个变异位点,占整个序列长度的1.07%。其中有9个变异位点属于碱基插入或缺失类型,占变异位点总数的90%,占整个序列长度的0.96%。有1个变异位点属于碱基替换类型,占整个变异位点总数的10%,占整个序列长度的0.11%。(2)整个rps16片段的序列共有10个变异位点,其中兰考泡桐与白花泡桐在总的变异位点上,具有一致的碱基位点9个,占总变异的90%。而兰考泡桐与毛泡桐相比,没有相同的碱基。[结论] 根据三种泡桐的rps16序列的序列特征和变异位点的分析,表明在叶绿体遗传方面,兰考泡桐具有与白花泡桐更多相似的遗传物质,其亲缘关系较近。综上所述,推测兰考泡桐与白花泡桐可能来自同一母系遗传。

English Abstract

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