利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

黄秦军; 苏晓华; 张香华

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

黄秦军 , 苏晓华 , 张香华

文章导航 > 林业科学研究 > 2004 > 17(3): 291-299

引用本文:

Citation:

利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

1.
中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091
基金项目:
国家"973"项目(G199901600004);"863"课题(2002AA241071)资助
中图分类号: S792.11

Genetic Linkage Mapping in F2 Population of Populus deltoides×P. cathayana by Using AFLP and SSR Marker

1.
Research Institute of Forestry, CAF, Beijing100091, China
CLC number: S792.11

摘要: 以美洲黑杨×青杨F2代为作图群体,利用AFLP和SSR标记技术构建分子连锁图谱。连锁图共有19个较大的连锁群,16个二联体(Doublets),7个三联体(Triplets)和5个较小的连锁群。19个较大的连锁群上包括356个AFLP标记和12个SSR标记,总图距为3382.4cM,标记间的平均间距为9.69cM。估计基因组长度为2607～3319cM,平均为3042cM,同时采用Lander和Bishop的方法计算期望基因组覆盖度,平均值分别为96.7%和98.4%。
- 美洲黑杨×青杨
- / AFLP
- / SSR
- / 遗传图谱
Abstract: Based on the techniques of amplified fragment length polymorphism (AFLP) and microsatellite (SSR) marker, a hybrid molecular linkage map of Populus deltoides×P. cathayana was constructed. 19 major groups, 16 doublets, 7 triplets and 5 small groups were identified in this map.356 AFLP makers and 12 SSR markers, total 368 makers, were ordered on the 19 major groups. This map covered 3 382.4 cM of genome length, and the average distance between two markers was 9.69 cM. The estimated genome length was between 2 607 cM and 3 319 cM and was 3 042 cM in average. The expected genome coverage was calculated and it was 96.7% with the equation of Lander,and it was 98.4% with method of Bishop et al.
- Populus deltoides×P. cathayana
- / AFLP
- / SSR
- / linkage map

[1]	张蕴哲 , 刘红霞 , 邬荣领 , 李明亮 , 胡建军 , 尹伟伦 , 韩一凡 . 毛新杨×毛白杨AFLP分子遗传图谱. 林业科学研究, 2003, 16(5): 595-603.
[2]	马庆国 , 王治军 , 徐慧敏 , 李明昆 , 李慧民 , 张俊佩 , 张建国 . 金丝楸优良无性系遗传多样性和亲缘关系的AFLP分析. 林业科学研究, 2020, 33(5): 145-153. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2020.05.018
[3]	茹广欣 , 袁金玲 , 张朵 , 郭广平 . 运用AFLP技术分析筇竹种群遗传多样性. 林业科学研究, 2010, 23(6): 850-855.
[4]	张香华 , 苏晓华 , 黄秦军 , 张冰玉 . 欧洲黑杨育种基因资源SSR多态性比较研究. 林业科学研究, 2006, 19(4): 477-483.
[5]	殷继艳 , 张建国 , 何彩云 , 保尔江 , 段爱国 , 曾艳飞 , 王健 . 新疆额尔齐斯河流域杨属植物种间关系的SSR分析. 林业科学研究, 2016, 29(1): 17-24.
[6]	谢一青 , 姚小华 , 李志真 , 黄勇 . 小果油茶农家品种间遗传差异及亲缘关系分析. 林业科学研究, 2014, 27(2): 201-207.
[7]	何旭东 , 郑纪伟 , 田雪瑶 , 教忠意 , 窦全琴 . 薄壳山核桃品种亲缘关系分析与指纹图谱构建. 林业科学研究, 2021, 34(4): 95-102. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.04.011
[8]	王天翼 , 徐悦 , 王罗云 , 张建国 , 曾艳飞 . 中国沙棘和云南沙棘的遗传分化及遗传多样性. 林业科学研究, 2021, 34(4): 13-21. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.04.002
[9]	刘梦培 , 傅大立 , 李芳东 , 傅建敏 , 田敏 , 梁臣 . 华仁杏杂种鉴定及遗传变异分析. 林业科学研究, 2012, 25(1): 88-92.
[10]	熊春艳 , 龚榜初 , 应尚蛟 , 吴开云 , 江锡兵 , 赵献民 . 不同产地金枣柿遗传变异研究. 林业科学研究, 2014, 27(2): 225-232.
[11]	郑书星 , 张建国 , 段爱国 , 何彩云 , 保尔江 , 王健 . 新疆阿尔泰地区白杨派3个树种半同胞家系子代遗传多样性分析. 林业科学研究, 2013, 26(3): 366-372.
[12]	李振 , 张勇 , 魏永成 , 孟景祥 , 仲崇禄 . 短枝木麻黄种子散布模式及子代群体的遗传多样性分析. 林业科学研究, 2021, 34(5): 24-31. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.005.003
[13]	田胜平 , 汪阳东 , 陈益存 , 占志勇 , 斯林林 . 山苍子AFLP反应体系的建立及其引物筛选. 林业科学研究, 2012, 25(2): 174-181.
[14]	. 喙尾琵甲DNA提取方法比较与AFLP反应体系的建立. 林业科学研究, 2010, 23(2): 234-240.
[15]	邓紫宇 , 陈健波 , 郭东强 , 李昌荣 , 卢翠香 . 大花序桉的遗传多样性分析. 林业科学研究, 2019, 32(4): 41-46. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.04.006
[16]	张艳丽 , 王雁 , 李正红 , 马宏 . 基于牡丹EST信息的滇牡丹SSR标记开发. 林业科学研究, 2011, 24(2): 171-175.
[17]	吴敏 , 杜红岩 , 乌云塔娜 , 刘攀峰 , 荆腾 . 杜仲基因组微卫星特征及SSR标记开发. 林业科学研究, 2015, 28(3): 387-393.
[18]	饶龙兵 , 杨汉波 , 郭洪英 , 段红平 , 陈益泰 . 基于桤木属转录组测序的SSR分子标记的开发. 林业科学研究, 2016, 29(6): 875-882.
[19]	杜明凤 , 丁贵杰 . 基于马尾松干旱转录组的抗旱功能SSR位点分析. 林业科学研究, 2018, 31(5): 9-19. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.05.002
[20]	张照远 , 甘四明 , 李发根 , 李梅 , 翁启杰 , 胡哲森 . EST-CAPS标记在尾叶桉和细叶桉遗传图谱构建中的应用. 林业科学研究, 2007, 20(2): 230-234.

点击查看大图

计量

文章访问数: 2934
HTML全文浏览量: 215
PDF下载量: 1655
被引次数: 0

利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

1. 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091

收稿日期: 2004-01-12

基金项目: 国家"973"项目(G199901600004);"863"课题(2002AA241071)资助

关键词:

摘要: 以美洲黑杨×青杨F2代为作图群体,利用AFLP和SSR标记技术构建分子连锁图谱。连锁图共有19个较大的连锁群,16个二联体(Doublets),7个三联体(Triplets)和5个较小的连锁群。19个较大的连锁群上包括356个AFLP标记和12个SSR标记,总图距为3382.4cM,标记间的平均间距为9.69cM。估计基因组长度为2607～3319cM,平均为3042cM,同时采用Lander和Bishop的方法计算期望基因组覆盖度,平均值分别为96.7%和98.4%。

English Abstract

全文HTML

下载: 全尺寸图片幻灯片

返回文章

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

留言板

利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

Genetic Linkage Mapping in F2 Population of Populus deltoides×P. cathayana by Using AFLP and SSR Marker

计量

出版历程

利用AFLP和SSR标记构建美洲黑杨×青杨遗传图谱

English Abstract

Genetic Linkage Mapping in F2 Population of Populus deltoides×P. cathayana by Using AFLP and SSR Marker

全文HTML

目录