• 中国中文核心期刊
  • 中国科学引文数据库(CSCD)核心库来源期刊
  • 中国科技论文统计源期刊(CJCR)
  • 第二届国家期刊奖提名奖

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析

李永 田国忠 朴春根 郭民伟 林乐民

引用本文:
Citation:

灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析

  • 基金项目:

    中国林业科学研究院森环森保所院所长基金项目(CAFRIFEEP201008);国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21207)

  • 中图分类号: S763

The Molecular Identification and Phylogeny of Tephrosia Witches’-broom Phytoplasma

  • CLC number: S763

  • 摘要: 实验应用PCR扩增、iPhyClassifer分析、序列同源性及系统发育分析等方法对海南省灰叶丛枝病病害进行了分子检测及其病原的鉴定、系统进化研究。iPhyClassifer结果显示:灰叶丛枝病植原体为花生丛枝组(16SrⅡ组)16SrⅡ-A成员。序列同源性分析结果表明:灰叶丛枝病植原体与16SrⅡ、 16SrⅡ-A成员同源性最高,如与花生丛枝病植原体16S rDNA的序列同源性为99.9%,rp基因为99.9%。基于16S rRNA和rp两基因构建的系统发育树显示:灰叶丛枝病植原体与花生丛枝病植原体、甘薯丛枝病植原体起源相同,且关系相当接近。根据以上结果,灰叶丛枝病植原体归为花生丛枝组(16SrII组)16SrⅡ-A亚组,与Candidatus Phytoplasma australasiae候选种相关。
  • [1]

    Seemüller E, Marcone C, Lauer U, et al. Current status of molecular classification of the phytoplasmas[J]. Journal of Plant Pathology, 1998, 80: 3-26
    [2] 李 永, 徐启聪, 田国忠,等. 猪屎豆丛枝病植原体的分子检测与鉴定[J]. 林业科学,2010, 46(1):163-168

    [3] 赖 帆,李 永,徐启聪,等. 植原体的最新分类研究动态[J]. 微生物学通报, 2008, 35(2):291-295

    [4]

    Zhao Y, Wei W, Lee I M, et al. Construction of an interactive online phytoplasma classification tool, iPhyClassifier, and its application in analysis of the peach X-disease phytoplasma group (16SrIII) [J]. Int J Syst Evol Microbiol, 2009, 59: 2582-2593
    [5]

    Lee I M, Hammond R W, Davis R E, et al. Universal amplification and analysis of pathogen 16S rDNA for classification and identification of mycoplasmalike organisms[J]. Phytopathology, 1993b,83: 834-842
    [6]

    Lee I M, Davis R E, Dawn E, et al. Phytoplasma: phytopathogenic mollicutes[J]. Annu Rev Microbiol, 2000, 54 :221-253
    [7]

    The IRPCM Phytoplasma/Spiroplasma Working Team-Phytoplasma taxonomy group. 'Candidatus Phytoplasma’ a taxon for the wall-less, non-helical prokaryotes that colonize plant phloem and insects[J]. Int J Syst Evol Microbiol, 2004, 54: 1243-1255
    [8]

    Wei W, Davis R E, Lee I M, et al. Computer-simulated RFLP analysis of 16S rRNA genes: identification of ten new phytoplasma groups[J]. Int J Syst Evol Microbiol, 2007, 57:1855-1867
    [9]

    Martini M, Lee I M, Bottner D, et al. Ribosomal protein gene-based phylogeny for finer differentiation and classification of phytoplasmas[J]. Int J Syst Evol Microbiol, 2007, 57: 2037-2051
    [10]

    Deng S, Hiruki C. Amplification of 16S rRNA genes from culturable and nonculturable Mollicutes[J]. J Microbiol Methods, 1991, 14:53-61
    [11] 温秀军,郭晓军,田国忠,等. 几个枣树品种和婆枣单株对枣疯病抗性的鉴定[J]. 林业科学,2005, 41(3):88-96

    [12] 王海妮,吴云锋,安凤秋,等. 枣疯病和酸枣丛枝病植原体16S rDNA 和tuf基因的序列同源性分析[J]. 中国农业科学, 2007, 40(10):2200-2205

  • [1] 耿显胜田国忠任争光宋传生林彩丽 . 泡桐丛枝植原体pPaWBNy-2-ORF4编码蛋白的抗体制备和表达分析. 林业科学研究, 2013, 26(4): 494-500.
    [2] 耿显胜张威仲建平张守科舒金平 . 早竹丛枝病的调查及病原菌的分子鉴定. 林业科学研究, 2017, 30(5): 805-811. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.05.014
    [3] 王圣洁林彩丽严东辉于少帅李永汪来发朴春根郭民伟淮稳霞田国忠 . 寡核苷酸管芯片技术检测和鉴别我国不同组植原体. 林业科学研究, 2017, 30(1): 99-110. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.01.014
    [4] 冯锦霞王敏杰闫伟 . 乳牛肝菌属分离株分子鉴定及其遗传关系的研究. 林业科学研究, 2008, 21(6): 825-831.
    [5] 刘仁林李江王琅 . 杜鹃属轮叶组类群的导管穿孔板多样性与系统发育的联系. 林业科学研究, 2008, 21(3): 301-307.
    [6] 江萍黄祥Sulaiman Shah何梦瑶 . 无叶假木贼叶绿体基因组特征系统发育及密码子偏好性分析. 林业科学研究, 2023, 36(4): 109-121. doi: 10.12403/j.1001-1498.20220578
    [7] 孙志强傅建敏乔杰闫正升杜奎宇董溯权 . 茶翅蝽对植原体的传播能力. 林业科学研究, 1999, 12(6): 606-611.
    [8] 丁永顺常志敏杨琳陈祥盛 . 乌桕新害虫——中华卡扁蜡蝉的形态及分子鉴定. 林业科学研究, 2018, 31(6): 69-75. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.06.010
    [9] 侯晓晖陈祥盛 . 利用16S rDNA基因序列进行害竹飞虱(半翅目:飞虱科)的分子鉴定. 林业科学研究, 2013, 26(1): 65-69.
    [10] 张文泉刁松锋孙晓薇罗国涛徐睿苏胜荣 . 雷公山国家级自然保护区7种棉革菌外生菌根形态描述和分子鉴定. 林业科学研究, 2018, 31(5): 176-184. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.05.024
    [11] 王子豪荣书利郝广斌王婷婷曹鹏王俊平 . 小粒绒盾小蠹Xyleborinus saxesenii(Ratzeburg,1873)的形态和分子鉴定. 林业科学研究, 2023, 36(3): 185-189. doi: 10.12403/j.1001-1498.20220594
    [12] 陈航陈晓鸣冯颖杨子祥 . 胶蚧属7种紫胶虫的支序系统学分析. 林业科学研究, 2008, 21(5): 599-604.
    [13] 王瑶孔祥波张苏芳刘福张真严善春 . 云南松毛虫线粒体基因组全序列测定和分析. 林业科学研究, 2019, 32(5): 11-20. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.05.002
    [14] 许秀玉徐斌甘先华仲崇禄张华新 . 木麻黄青枯病菌的分离及强致病菌株的筛选. 林业科学研究, 2017, 30(3): 409-416. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.03.007
    [15] 任维宾杨子祥杨瑛吴海霞陈航 . 9种瘿蚜的Wolbachia分子检测和系统发育分析. 林业科学研究, 2018, 31(3): 1-8. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.03.001
    [16] 尹立伟池玉杰王雪童 . 灰树花的系统发育分析和主要木质素降解酶的测定. 林业科学研究, 2010, 23(4): 574-580.
    [17] 田国忠温秀军李永孙朝晖赵玉芬郭晓军黄钦才李志清赵俊芳 . 枣疯病和泡桐丛枝病原植原体分离物的组织培养保藏和嫁接传染研究. 林业科学研究, 2005, 18(1): 1-9.
    [18] 宋传生胡佳续林彩丽任争光耿显胜田国忠 . 泡桐丛枝植原体胸苷酸激酶的原核表达、纯化及酶活性测定. 林业科学研究, 2014, 27(6): 786-793.
    [19] 金开璇汪跃张锐王敏王以莲 . 山楂丛枝病类菌原体(MLO)的电镜观察. 林业科学研究, 1992, 5(3): 365-366.
    [20] 金开璇 . 泡桐丛枝病类菌原体(MLO)病原传染长春花研究初报. 林业科学研究, 1988, 1(1): 106-108.
  • 加载中
计量
  • 文章访问数:  3233
  • HTML全文浏览量:  229
  • PDF下载量:  1922
  • 被引次数: 0
出版历程
  • 收稿日期:  2010-12-06

灰叶丛枝病病原的分子鉴定及系统发育分析

  • 1. 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所,国家林业局森林保护学重点实验室,北京 100091
  • 2. 中国林业科学研究院林业研究所,北京 100091
基金项目:  中国林业科学研究院森环森保所院所长基金项目(CAFRIFEEP201008);国家科技基础条件平台建设项目(2005DKA21207)

摘要: 实验应用PCR扩增、iPhyClassifer分析、序列同源性及系统发育分析等方法对海南省灰叶丛枝病病害进行了分子检测及其病原的鉴定、系统进化研究。iPhyClassifer结果显示:灰叶丛枝病植原体为花生丛枝组(16SrⅡ组)16SrⅡ-A成员。序列同源性分析结果表明:灰叶丛枝病植原体与16SrⅡ、 16SrⅡ-A成员同源性最高,如与花生丛枝病植原体16S rDNA的序列同源性为99.9%,rp基因为99.9%。基于16S rRNA和rp两基因构建的系统发育树显示:灰叶丛枝病植原体与花生丛枝病植原体、甘薯丛枝病植原体起源相同,且关系相当接近。根据以上结果,灰叶丛枝病植原体归为花生丛枝组(16SrII组)16SrⅡ-A亚组,与Candidatus Phytoplasma australasiae候选种相关。

English Abstract

参考文献 (12)

目录

    /

    返回文章
    返回