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基于CE-AFLP的5个美洲黑杨新品种指纹图谱分析

贾会霞 ,  胡建军 ,  卢孟柱

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文章导航 > 林业科学研究  > 2013 >  26(3): 281-286
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shu

基于CE-AFLP的5个美洲黑杨新品种指纹图谱分析

  • 1.

    林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091

  • 基金项目:

    林业行业公益类重大专项(201304103);"863"计划(2011AA100201);林木遗传育种国家重点实验室专项课题(CAFYBB2012041)

  • 中图分类号: S718.46

Fingerprint Analysis of Five New Cultivars of Populus deltoides Based on CE-AFLP

  • 1.

    State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Research Institute of Forestry, Chinese Academy of Forestry, Key Laboratory of Tree Breeding and Cultivation of State Forestry Administration, Beijing 100091, China

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 以5个美洲黑杨新品种(丹红杨、南杨、中林2025杨、中红杨和全红杨)为实验材料,利用CE-AFLP(毛细管电泳-AFLP)技术,采用EcoR I+3/Mse I+3和Pst I+2/Mse I+3引物组合构建指纹图谱,并进行遗传多样性分析。结果表明:从36对引物组合中筛选出12对扩增条带数目多、稳定且清晰的引物进行扩增,共获得条带数877条,多态性条带数315条,平均多态率为35.92%。采用UPGMA法进行聚类分析,相似系数为0.74 1.00;丹红杨与南杨之间的差异较大;在相似系数0.98时,中林2025杨与中红杨和全红杨分为两类,11条稳定特异的条带可以作为鉴别它们的依据;全红杨和中红杨之间未监测到稳定清晰的特异条带,初步认为2个品种在基因组水平上没有明显差异。
    Abstract: CE-AFLP(Capillary electrophoresis-amplified fragment length polymorphism)was used to construct the fingerprint and analyze the genetic diversity of five new cultivars of Populus deltoides, including Populus deltoides CL. ‘Danhong’, P. deltoides CL. ‘Nan’, P. deltoides CL. ‘Zhonglin2025’, P. deltoides CL. ‘Zhonghong’, and P. deltoides CL. ‘Quanhong’. The primer combinations of EcoR I+3/Mse I+3 and Pst I+2/Mse I+3 were used in this study. The result indicated that 12 pairs of primers could be detected with many stable and clear amplified bands in all the 36 primer pairs. 877 bands were obtained, including 315 polymorphic bands, and the polymorphism frequency was 35.92%. UPGMA cluster analysis showed that the similarity coefficient ranged from 0.74 to 1.00. The difference between ‘Danhong’ and ‘Nan’ was large. The similarity coefficient of ‘Zhonghong’ and ‘Quanhong’ with ‘Zhonglin2025’ was 0.98. 11 stable and clear specific bands could be used to identify these cultivars. There were not detected stable and clear specific bands between ‘Zhonghong’ and ‘Quanhong’. It suggested that the variability of genomic between the two cultivars was not dramatic.
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-01-16

基于CE-AFLP的5个美洲黑杨新品种指纹图谱分析

  • 1. 林木遗传育种国家重点实验室, 中国林业科学研究院林业研究所, 国家林业局林木培育重点实验室, 北京 100091
  • 收稿日期: 2012-01-16
基金项目:  林业行业公益类重大专项(201304103);"863"计划(2011AA100201);林木遗传育种国家重点实验室专项课题(CAFYBB2012041)

摘要: 以5个美洲黑杨新品种(丹红杨、南杨、中林2025杨、中红杨和全红杨)为实验材料,利用CE-AFLP(毛细管电泳-AFLP)技术,采用EcoR I+3/Mse I+3和Pst I+2/Mse I+3引物组合构建指纹图谱,并进行遗传多样性分析。结果表明:从36对引物组合中筛选出12对扩增条带数目多、稳定且清晰的引物进行扩增,共获得条带数877条,多态性条带数315条,平均多态率为35.92%。采用UPGMA法进行聚类分析,相似系数为0.74 1.00;丹红杨与南杨之间的差异较大;在相似系数0.98时,中林2025杨与中红杨和全红杨分为两类,11条稳定特异的条带可以作为鉴别它们的依据;全红杨和中红杨之间未监测到稳定清晰的特异条带,初步认为2个品种在基因组水平上没有明显差异。

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