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普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

林萍 姚小华 曹永庆 龙伟 王开良 滕建华

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普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

  • 基金项目:

    国家林业公益性行业科研专项“林改后南方林地可持续高效经营关键技术研究与集成示范”(201004008);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目“油茶品种分子鉴别系统构建及油茶基因芯片开发”(RISF6804)

  • 中图分类号: S718.46

Characterization of a Novel Ubiquitin-conjugating Enzyme from Camellia oleifera

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为 UBE2-J2, 该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8~122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75~122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员。
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出版历程
  • 收稿日期:  2012-09-26

普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

  • 1. 中国林业科学研究院亚热带林业研究所, 浙江 富阳 311400
  • 2. 浙江省金华市东方红林场, 浙江 金华 321025
基金项目:  国家林业公益性行业科研专项“林改后南方林地可持续高效经营关键技术研究与集成示范”(201004008);中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目“油茶品种分子鉴别系统构建及油茶基因芯片开发”(RISF6804)

摘要: 泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为 UBE2-J2, 该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8~122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75~122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于Ⅱ类E2基因家族成员。

English Abstract

参考文献 (30)

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