基于SSR分子标记的杜仲遗传多样性体系建立

黄海燕; 杜红岩; 乌云塔娜; 朱高浦

基于SSR分子标记的杜仲遗传多样性体系建立

1.
中国林业科学研究院经济林研究开发中心, 河南郑州 450003
2.
国家林业局经济林育种与栽培重点实验室, 湖南长沙 410004
基金项目:
国家林业公益性行业科研专项（201004029）、国家十二五科技支撑计划（2012BAD21B0502）
中图分类号: S718.46

Establishment of Genetic Diversity System of Eucommia ulmoides Based on SSR Molecular Markers

1.
Non-timber Forestry Research and Development Center, Chinese Academy of Forestry, Zhengzhou 450003, He'nan, China
2.
Key Laboratory of Non-wood Forest Products of State Forestry Administration, Changsha 410004, Hu'nan, China
CLC number: S718.46

- 杜仲
- / 种质资源
- / SSR-PCR反应体系
- / 引物筛选
Abstract: In order to set up the genetic diversity system of Eucommia ulmoides Oliver based on SSR molecular markers, the establishment of SSR-PCR reaction system and screening out SSR marker primer showing high polymorphism were studied. A L9(34) orthogonal design was performed to optimize the main factors of the SSR-PCR reaction system. The results indicated that the best SSR-PCR reaction system for E.ulmoides was DNA template 1 μL (30~60 ng·μL-1), 2×Taq PCR Master Mix 10 μL, primer 1 μL with the total volume of 25 μL. The PCR reaction system had high stability and repeatability, the pairs of SSR primers with high polymorphism were gotten. The 8 E.ulmoides samples' DNA sequence was amplified with 13 pairs of SSR primers by SSR-PCR technique, 34 alleles were detected, 2.6 alleles were detected from per site on average. Each allele's effective number was 1.751 5, and the h value was 0.379 8, the average I value was 0.643 3. This study is helpful in using SSR molecular marker to analyze genetic diversity and genetic relationship in E. ulmoides.
- Eucommia ulmoides Oliver
- / germplasm resources
- / optimization of SSR-PCR system
- / primer screening

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