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落叶松实时定量PCR内参基因的筛选

吴涛 李万峰 张俊红 韩素英 杨文华 齐力旺

引用本文:
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落叶松实时定量PCR内参基因的筛选

  • 基金项目:

    国家"973"计划项目(2009CB119106);国家自然科学基金(30830086,31200464);国家"863"计划项目(2011AA100203,2013AA102704) 资助

  • 中图分类号: S791.22

Stability Analysis of Reference Genes for Larch Gene Expression Studies by Quantitative Real-Time PCR

  • CLC number: S791.22

  • 摘要: 本研究针对日本落叶松(Larix kaempferi (Lamb.) Carr.)体细胞胚胎发育过程中原胚团时期到胚胎成熟时期、种子萌发过程、植株幼年生长阶段和成年生长阶段等生长发育过程中的31份材料,应用实时荧光定量PCR(qPCR)技术,分析了12个持家基因(ACT 4、APm、Chc、Gapc、RPL1、RPL2、EF1、EF2、eIF、E3UL、UBQ和UPL2) 在这31份材料中的表达情况。经geNorm和NormFinder两种分析软件对这12个持家基因进行表达稳定性分析,结果表明:APm在不同器官、体细胞胚胎发育和种子萌发过程中表达均最为稳定;EF1 在不同生长年龄植株的顶梢中表达最为稳定;eIF在不同年龄植株的针叶中表达最为稳定。分析结果表明,针对不同的研究材料和发育阶段应选择适合的持家基因做内参基因使用。进行基因表达细微差异研究时,可根据需要使用2个或2个以上内参组合。
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-08-22

落叶松实时定量PCR内参基因的筛选

  • 1. 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091
  • 2. 国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室, 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室, 云南 昆明 650201
  • 3. 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所, 北京 100091
基金项目:  国家"973"计划项目(2009CB119106);国家自然科学基金(30830086,31200464);国家"863"计划项目(2011AA100203,2013AA102704) 资助

摘要: 本研究针对日本落叶松(Larix kaempferi (Lamb.) Carr.)体细胞胚胎发育过程中原胚团时期到胚胎成熟时期、种子萌发过程、植株幼年生长阶段和成年生长阶段等生长发育过程中的31份材料,应用实时荧光定量PCR(qPCR)技术,分析了12个持家基因(ACT 4、APm、Chc、Gapc、RPL1、RPL2、EF1、EF2、eIF、E3UL、UBQ和UPL2) 在这31份材料中的表达情况。经geNorm和NormFinder两种分析软件对这12个持家基因进行表达稳定性分析,结果表明:APm在不同器官、体细胞胚胎发育和种子萌发过程中表达均最为稳定;EF1 在不同生长年龄植株的顶梢中表达最为稳定;eIF在不同年龄植株的针叶中表达最为稳定。分析结果表明,针对不同的研究材料和发育阶段应选择适合的持家基因做内参基因使用。进行基因表达细微差异研究时,可根据需要使用2个或2个以上内参组合。

English Abstract

参考文献 (22)

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