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黑杨三倍体与二倍体叶片中miRNA表达差异研究

王楠 胡宝全 王春国 宋文芹 陈成彬

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黑杨三倍体与二倍体叶片中miRNA表达差异研究

  • 基金项目:

    国家"973"计划项目(2009CB119105);国家自然科学基金重点项目(31371249)

  • 中图分类号: S718.46

Study on the Difference in Expression Profiles of microRNA Among Leaf Organs of Triploid and Diploid Populus×euramericana cl.‘Zhonglin46’

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 本文以改进CTAB法提取的总RNA为模板,通过设计茎环反转录引物,利用定量RT-PCR技术从黑杨幼嫩叶片、成熟叶片中均检测到miRNA。结果表明,miR159、miR167、miR171、miR319在三倍体幼叶中表达量均高于二倍体,miR164在三倍体成熟叶片中的表达量高于二倍体表达量。除miR319外,其余miRNA与其相应的靶基因在二倍体和三倍体黑杨不同阶段叶片中表达的消长关系都较为典型。暗示这些miRNA 靶基因可能与黑杨三倍体的速生性状形成相关。
  • [1]

    Lee R C,Feinbaum R L, Ambros V.The C. elegans heterochronic gene lin- 4 enc-odes small RNAs with antisense complementarity to lin- 14 [J].Cell, 1993, 75(5):843-854
    [2]

    Wightman B,Ha I,Ruvkun G.Posttranscriptional regulation of the heterochronic gene lin- 14 by lin- 4 mediates temporal pattern formation in C. elegans [J].Cell,1993,75(5):855-862
    [3]

    Reinhart B J,Weinstein E G,Rhoades M W, et al. MicroRNAs in plants [J].Genes & Development,2002,16(13):1616-1626
    [4]

    Schwab R, Palatnik J F, Riester M, et al. Specific effects of microRNAs on the plant transcriptome [J]. Developmental Cell, 2005, 8(4):517-527
    [5]

    Jacobsen S E, Running M P, Meyerowitz E M. Disruption of an RNA helicase/RNAse Ⅲ gene in Arabidopsis causes unregulated cell division in floral meristems [J]. Development, 1999, 126(23):5231-5243
    [6]

    Wang J W, Wang L J, Mao Y B, et al. Control of root cap formation by MicroRNA-targeted auxin response factors in Arabidopsis[J]. Plant Cell, 2005, 17(8):2204-2216
    [7]

    Williams L, Grigg S P, Xie M, et al. Regulation of Arabidopsis shoot apical meristem and lateral organ formation by microRNA miR166g and its AtHD-ZIP target genes [J]. Development, 2005, 132(16):3657-3668
    [8] 陈成彬, 齐力旺, 张守攻,等. 三倍体杨树核型分析[J]. 武汉植物学研究,2004, 22(6):565-567

    [9]

    Chen C F, Ridzon D A, Brootner A J, et al. Real-time quantification of microRNAs by stem-loop RT-PCR [J]. Nucleic Acids Research, 2005, 33(20):179-187
    [10]

    Kiefer E, Heller W, Ernst D. A simple and efficient protocol for isolation of functional RNA from plant tissues rich in secondary metabolites [J]. Plant Mol Biol Rep, 2000, 18(1): 33-39
    [11]

    Palatnik J F,Allen E.Control of leaf morphogenesis by miRNAs[J].Nature,2003, 425(6955):257-263
    [12]

    Allen R S, Li J, Stable M I, et al. Genetic analysis reveals functional redundancy and the major target genes of the Arabidopsis miR159 family [J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2007, 104(41):16371-16376
    [13]

    Bonnet E, Wuyts J, Rouzé P, et al. Detection of 91 potential conserved plant microRNAs in Arabidopsis thaliana and Oryza sativa identifies important target genes [J]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,2004, 101(31): 11511-11516
    [14]

    Guo M,Davis D,Birchler J A.Dosage effects on gene expression in a maize ploidy series[J].Genetics, 1996,142(4):1349-1355
    [15]

    Tariq M,Paszkowski,J.DNA and histone methylation in plants [J].Trends in Genetics, 2004, 20(6):244-251
    [16]

    Nath U,Crawford B C,Carpenter R, et al.Genetic control of surface curvature [J].Science,2003, 299(5611):1404-1407
    [17]

    Palatnik J F,Allen E,Wu X, et al.Control of leaf morphogenesis by microRNAs [J].Nature,2003, 425(6955):257-263
    [18]

    Ori N,Cohen A R,Etzioni A, et al.Regulation of LANCEOLATE by miR319 is required for compound-leaf development in tomato[J].Nature Genetics, 2007, 39(6):787-791
    [19]

    Masterson J.Stomatal size in fossil plants: evidence for polyploidy in majority of angiosperms[J].Science, 1994, 264(5157):421-424
    [20]

    Chen Z J,Ni Z.Mechanisms of genomic rearrangements and gene expression changes in plant polyploids[J].Bioessays, 2006, 28(3):240-252
    [21] 谭建新,孙玉洁. 表观基因组学研究方法进展与评价[J].遗传, 2009, 31(1):7-16

    [22]

    Kim J, Woo H, Kim J, et al. Trifurcate feed-forward regulation of age-dependent cell death involving miR164 in Arabidopsis[J]. Science, 2009, 323(5917):1053-1057
  • [1] 李丹蕾张瑞芝王峰陈俏丽牛春阳零雅茗郝昕 . MicroRNA转录后调控欧美杨R2R3-MYBs抗锈菌表达. 林业科学研究, 2017, 30(2): 254-259. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.02.010
    [2] 张俊红吴涛韩素英齐力旺张守攻 . 落叶松体胚发育中12个针叶树特异microRNAs表达分析. 林业科学研究, 2012, 25(4): 411-418.
    [3] 朱建峰李万峰杨文华韩素英齐力旺 . 中间锦鸡儿生长发育过程中5个miRNAs及其靶基因的表达模式分析. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 45-51.
    [4] 陈成彬王彬胡宝全王春国宋文芹 . 黑杨DNA甲基转移酶基因片段的分离及表达分析. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 87-95.
    [5] 金顺玉卢孟柱高 健 . 毛竹木质素合成相关基因C4H的克隆及组织表达分析. 林业科学研究, 2010, 23(3): 319-325.
    [6] 暴帅孔雪邢磊张翠霞官民晓赵丽红刘闯刘雪梅 . 白桦雄花序发育早期和中期差异表达基因的cDNA-AFLP分析. 林业科学研究, 2014, 27(4): 466-473.
    [7] 范立鹏王军辉于占晶黄范全孔祥波王鸿斌张苏芳张真 . 杨小舟蛾成虫对5种黑杨无性系的寄主选择行为. 林业科学研究, 2014, 27(4): 459-465.
    [8] 张俊红张守攻童再康李万峰韩素英齐力旺 . 植物中MicroRNA及其它非编码小RNA的保守性和进化历程. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 103-108.
    [9] 胡宝全韦韬王春国宋文芹陈成彬 . 黑杨三倍体 PtSIP3基因的克隆与功能分析. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 39-44.
    [10] 李红英陈萌笛王政博郝自远刘龙昌赵西平倪建伟 . 镉胁迫下构树qRT-PCR内参基因筛选及验证. 林业科学研究, 2023, 36(4): 129-138. doi: 10.12403/j.1001-1498.20220500
    [11] 周亚楠李爱陈成彬王春国宋文芹 . 日本落叶松杂种及亲本 4CL基因的克隆和SNP多态性分析. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 18-24.
    [12] 孙涛王雪庆赵遵岭于淑慧陈晓鸣刘魏魏亓倩杨璞 . 白蜡虫热激蛋白序列分析. 林业科学研究, 2016, 29(5): 778-783.
    [13] 华雅洁岳远征杨秀莲何卿 . 海州常山叶片实时荧光定量PCR的内参基因选择. 林业科学研究, 2022, 35(2): 194-202. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.02.023
    [14] 谢婉凤梁光红 . 松材线虫侵染下马尾松针叶miRNA和mRNA的关联表达. 林业科学研究, 2018, 31(6): 7-14. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.06.002
    [15] 王凯英高茜孙晓明张琰锋严东辉 . 黑杨应答杨生褐盘二孢专化型侵染的基因差异表达. 林业科学研究, 2017, 30(4): 582-587. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.04.007
    [16] 周成城荣俊冬谢德金杨德明何天友郑郁善 . 福建柏实时荧光定量PCR内参基因的选择. 林业科学研究, 2021, 34(1): 137-145. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.01.017
    [17] 谢丽华蒋晶刘明英乔桂荣邱文敏杨惠琴卓仁英 . ptc-miR213的人工microRNA植物表达载体的 构建及遗传转化. 林业科学研究, 2013, 26(1): 29-33.
    [18] 郭晓娟陈凌娜杨汉奇 . 巨龙竹秆形发育过程实时荧光定量PCR内参基因的筛选. 林业科学研究, 2018, 31(2): 120-125. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.02.017
    [19] 张恺恺吕星杨立莹陈段芬邱德有杨艳芳 . 红豆杉TbAP2基因荧光定量PCR体系的建立及优化. 林业科学研究, 2019, 32(1): 39-46. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.01.006
    [20] 张颖陈婉婷陈冉红帅鹏李明 . 杉木实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择. 林业科学研究, 2019, 32(2): 65-72. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.02.010
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-08-20

黑杨三倍体与二倍体叶片中miRNA表达差异研究

  • 1. 南开大学生命科学学院, 天津 300071
基金项目:  国家"973"计划项目(2009CB119105);国家自然科学基金重点项目(31371249)

摘要: 本文以改进CTAB法提取的总RNA为模板,通过设计茎环反转录引物,利用定量RT-PCR技术从黑杨幼嫩叶片、成熟叶片中均检测到miRNA。结果表明,miR159、miR167、miR171、miR319在三倍体幼叶中表达量均高于二倍体,miR164在三倍体成熟叶片中的表达量高于二倍体表达量。除miR319外,其余miRNA与其相应的靶基因在二倍体和三倍体黑杨不同阶段叶片中表达的消长关系都较为典型。暗示这些miRNA 靶基因可能与黑杨三倍体的速生性状形成相关。

English Abstract

参考文献 (22)

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