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中间锦鸡儿生长发育过程中5个miRNAs及其靶基因的表达模式分析

朱建峰 李万峰 杨文华 韩素英 齐力旺

引用本文:
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中间锦鸡儿生长发育过程中5个miRNAs及其靶基因的表达模式分析

  • 基金项目:

    国家"973"计划项目(2009CB119106);国家"863"计划重点项目(2011AA100203,2013AA102704)资助

  • 中图分类号: S718.46

Expression Analysis of 5 miRNAs and Their Targets During Different Growth and Developmental Stages of Caragana intermedia

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 利用qRT-PCR技术分析了5个miRNAs(cin-miR157a、cin-miR159a、cin-miR165a、cin-miR172b和cin-miR396a)及其靶基因在中间锦鸡儿(Caragana intermedia)不同发育阶段不同器官的表达变化。结果显示,5个miRNAs的表达模式均存在时空特异性,其中cin-miR159a、cin-miR165a、cin-miR172b、cin-miR396a在成年期营养器官中强烈表达,在幼年期和成年期生殖器官中弱表达;cin-miR157a在幼年期和成年期生殖器官中强烈表达,在成年期营养器官中弱表达。除cin-miR159a的靶基因MYB和cin-miR165a的靶基因HD-Zip Ⅲ外,其它被检测的miRNAs靶基因与相应的miRNAs的表达呈现出明显的相互消长的表达模式。该结果表明中间锦鸡儿miRNA可通过调控其靶基因的表达,进而调控发育阶段转变、器官形态建成、细胞分化等生物学过程。研究结果将为中间锦鸡儿的定向改良工作提供理论依据和基因资源。
  • [1]

    Ambros V. MicroRNAs: tiny regulators with great potential[J]. Cell, 2001, 107: 823-826
    [2]

    Bartel D P. MicroRNAs: genomics, biogenesis, mechanism, and function[J]. Cell, 2004, 116: 281-297
    [3]

    Carrington J C, Ambros V. Role of microRNAs in plant and animal development[J]. Science, 2003, 301: 336-338
    [4]

    Lee R C, Feinbaum R L, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14[J]. Cell, 1993, 75: 843-854
    [5]

    Lagos-Quintana M, Rauhut R, Lendeckel W, et al. Identification of novel genes coding for small expressed RNAs[J]. Science, 2001, 294: 853-858
    [6]

    Lau N C, Lim L P, Weinstein E G, et al. An abundant class of tiny RNAs with probable regulatory roles in Caenorhabditis elegans[J]. Science, 2001, 294: 858-862
    [7]

    Lee R C, Ambros V. An extensive class of small RNAs in Caenorhabditis elegans[J]. Science, 2001, 294: 862-864
    [8]

    Llave C, Kasschau K D, Rector M A, et al. Endogenous and silencing-associated small RNAs in plants[J]. Plant Cell, 2002, 14: 1605-1619
    [9]

    Reinhart B J, Weinstein E G, Rhoades M W, et al. MicroRNAs in plants[J]. Genes Dev, 2002, 16: 1616-1626
    [10]

    Kurihara Y, Watanabe Y. Arabidopsis micro-RNA biogenesis through Dicer-like 1 protein functions[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2004, 101: 12753-12758
    [11]

    Qi Y, Denli A M, Hannon G J. Biochemical specialization within Arabidopsis RNA silencing pathways[J]. Molecular Cell, 2005, 19: 421-428
    [12]

    Jones-Rhoades M W, Bartel D P, Bartel B. MicroRNAs and their regulatory roles in plants[J]. Annu Rev Plant Biol, 2006, 57: 19-53.
    [13]

    Chiou T J, Aung K, Lin S I, et al. Regulation of phosphate homeostasis by MicroRNA in Arabidopsis[J]. Plant Cell, 2006, 18: 412-421
    [14]

    Zhang B, Pan X, Cobb G P, et al. Plant microRNA: a small regulatory molecule with big impact [J]. Developmental Biology, 2006, 289: 3-16
    [15]

    Jia S S, Zhou G K. Isolation and identification of isoflavones in the root of Caragana intermedia Kuang[J]. Zhong Yao Tong Bao, 1988, 13: 34-35, 59
    [16] 牛西午. 中国锦鸡儿属植物资源研究—分布及分种描述[J]. 西北植物学报, 1999, 19 (5): 107-133

    [17] 牛西午. 柠条研究[M]. 北京:科学出版社, 2003: 1-2

    [18]

    Shi S Q, Shi Z, Jiang Z P, et al. Effects of exogenous GABA on gene expression of Caragana intermedia roots under NaCl stress: regulatory roles for H2O2 and ethylene production [J]. Plant Cell and Environment,2010, 33: 149-162
    [19]

    Xu Z Z, Zhou G S, Wang Y H. Combined effects of elevated CO2 and soil drought on carbon and nitrogen allocation of the desert shrub Caragana intermedia[J]. Plant and Soil, 2007, 301: 87-97
    [20]

    Guo W H, Li B, Zhang X S, et al. Effects of water stress on water use efficiency and water balance components of Hippophae rhamnoides and Caragana intermedia in the soil-plant-atmosphere continuum [J]. Agroforestry Systems, 2010, 80: 423-435
    [21]

    De Paola D, Cattonaro F, Pignone D, et al. The miRNAome of globe artichoke: conserved and novel micro RNAs and target analysis[J]. Bmc Genomics, 2012, 13: 41
    [22]

    Xie F, Frazier T P, Zhang B. Identification and characterization of microRNAs and their targets in the bioenergy plant switchgrass (Panicum virgatum)[J]. Planta, 2010, 232: 417-434
    [23]

    Willmann M R, Poethig R S. Time to grow up: the temporal role of smallRNAs in plants[J]. Curr Opin Plant Biol, 2005, 8: 548-552
    [24]

    Wang J W, Czech B, Weigel D. miR156-regulated SPL transcription factors define an endogenous flowering pathway in Arabidopsis thaliana[J]. Cell, 2009, 138: 738-749
    [25]

    Wu G, Park M Y, Conway S R, et al. The sequential action of miR156 and miR172 regulates developmental timing in Arabidopsis[J]. Cell, 2009, 138: 750-759
    [26]

    Chuck G, Meeley R, Hake S. Floral meristem initiation and meristem cell fate are regulated by the maize AP2 genes ids1 and sid1 [J]. Development, 2008, 135: 3013-3019
    [27]

    Rodriguez R E, Mecchia M A, Debernardi J M, et al. Control of cell proliferation in Arabidopsis thaliana by microRNA miR396[J]. Development, 2010, 137: 103-112
  • [1] 张俊红吴涛韩素英齐力旺张守攻 . 落叶松体胚发育中12个针叶树特异microRNAs表达分析. 林业科学研究, 2012, 25(4): 411-418.
    [2] 汪阳东李春秀齐力旺张守攻 . 中间锦鸡儿fad2基因片段克隆、反义表达载体构建及遗传转化初步研究. 林业科学研究, 2007, 20(1): 6-9.
    [3] 李丹蕾张瑞芝王峰陈俏丽牛春阳零雅茗郝昕 . MicroRNA转录后调控欧美杨R2R3-MYBs抗锈菌表达. 林业科学研究, 2017, 30(2): 254-259. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.02.010
    [4] 武苾菲李万峰徐海燕张立峰齐力旺韩素英 . 中间锦鸡儿CiDR1的克隆及干旱胁迫下的表达分析. 林业科学研究, 2017, 30(2): 238-244. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2017.02.008
    [5] 王楠胡宝全王春国宋文芹陈成彬 . 黑杨三倍体与二倍体叶片中miRNA表达差异研究. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 33-38.
    [6] 单雪萌王思宁朱成磊高志民 . 毛竹 PeCPD 基因克隆与表达分析. 林业科学研究, 2019, 32(5): 58-66. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2019.05.008
    [7] 李琴王磊张雪潘昱伶王玥余殿 . 不同种植年限中间锦鸡儿叶片功能性状的差异性研究. 林业科学研究, 2023, 36(4): 173-182. doi: 10.12403/j.1001-1498.20230082
    [8] 王菁李爱王春国宋文芹陈成彬 . 日本落叶松 UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析. 林业科学研究, 2013, 26(S1): 76-81.
    [9] 王江英范正琪殷恒福李辛雷吴斌李纪元 . 杜鹃红山茶CaAPX基因的克隆、表达及功能分析. 林业科学研究, 2016, 29(4): 471-479.
    [10] 张恺恺杨立莹丰美静张林凤陈段芬邱德有杨艳芳 . 曼地亚红豆杉NAC基因家族鉴定及表达分析. 林业科学研究, 2022, 35(2): 97-103. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.02.011
    [11] 安静万友名马宏刘雄芳张秀姣曹毓蓉李正红 . 地涌金莲MlCYP734A6基因的克隆与表达分析. 林业科学研究, 2021, 34(3): 37-45. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.03.004
    [12] 黄国文管天球赵雨云陈莫林刘宏辉 . 油茶转录因子基因CoSOC1-like的克隆和表达分析. 林业科学研究, 2022, 35(2): 129-139. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2022.02.015
    [13] 章晶晶郭英华赵树堂卢孟柱 . 杨树PtRRI基因的组织特异性表达模式分析. 林业科学研究, 2018, 31(2): 34-40. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.02.005
    [14] 赵岩秋周厚君魏凯丽江成宋学勤卢孟柱 . 杨树中Ⅰ类KNOX基因结构、表达与功能分析. 林业科学研究, 2018, 31(4): 118-125. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2018.04.017
    [15] 李龙张立峰齐力旺韩素英 . 日本落叶松体细胞胚胎发生相关基因LaSERK1的克隆与表达分析. 林业科学研究, 2013, 26(6): 673-680.
    [16] 张婷丁贵杰文晓鹏 . 马尾松紫色酸性磷酸酶基因PmPAP1的克隆与表达模式分析. 林业科学研究, 2016, 29(6): 797-806.
    [17] 范艳如兰倩韩素英齐力旺张立峰 . 日本落叶松LaSPL2LaSPL3在体细胞胚发育中的表达分析. 林业科学研究, 2021, 34(5): 79-87. doi: 10.13275/j.cnki.lykxyj.2021.005.009
    [18] 史倩倩周琳李奎王雁 . 云南野生黄牡丹PlbHLH3转录因子基因的克隆与表达. 林业科学研究, 2015, 28(4): 488-496.
    [19] 程华李琳玲许锋王燕程水源 . 银杏过氧化氢酶基因CAT1的克隆及表达分析. 林业科学研究, 2010, 23(4): 493-499.
    [20] 林琳李健李慧玉穆怀志姜静 . 逆境胁迫下柽柳脂质转运蛋白基因 (ThLTP)的克隆与功能初步分析. 林业科学研究, 2012, 25(4): 492-499.
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-08-24

中间锦鸡儿生长发育过程中5个miRNAs及其靶基因的表达模式分析

  • 1. 中国林业科学研究院林业研究所, 北京 100091
  • 2. 中国林业科学研究院森林生态环境与保护研究所, 北京 100091
基金项目:  国家"973"计划项目(2009CB119106);国家"863"计划重点项目(2011AA100203,2013AA102704)资助

摘要: 利用qRT-PCR技术分析了5个miRNAs(cin-miR157a、cin-miR159a、cin-miR165a、cin-miR172b和cin-miR396a)及其靶基因在中间锦鸡儿(Caragana intermedia)不同发育阶段不同器官的表达变化。结果显示,5个miRNAs的表达模式均存在时空特异性,其中cin-miR159a、cin-miR165a、cin-miR172b、cin-miR396a在成年期营养器官中强烈表达,在幼年期和成年期生殖器官中弱表达;cin-miR157a在幼年期和成年期生殖器官中强烈表达,在成年期营养器官中弱表达。除cin-miR159a的靶基因MYB和cin-miR165a的靶基因HD-Zip Ⅲ外,其它被检测的miRNAs靶基因与相应的miRNAs的表达呈现出明显的相互消长的表达模式。该结果表明中间锦鸡儿miRNA可通过调控其靶基因的表达,进而调控发育阶段转变、器官形态建成、细胞分化等生物学过程。研究结果将为中间锦鸡儿的定向改良工作提供理论依据和基因资源。

English Abstract

参考文献 (27)

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