日本落叶松 UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析

王菁; 李爱; 王春国; 宋文芹; 陈成彬

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日本落叶松 UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析

王菁 , 李爱 , 王春国 , 宋文芹 , 陈成彬

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日本落叶松 UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析

1.
南开大学生命科学学院, 天津 300071
基金项目:
国家"973"计划项目(2009CB119105)
中图分类号: S791.223

Cloning and Expression of UDP-Glucose Dehydrogenase Cdna in Larix kaempferi

1.
College of Life Sciences, Nankai University, Tianjin 300071, China
CLC number: S791.223

摘要: 以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据,经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UDPGDH)原序列,以该序列两端设计引物,在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列,序列长1 443 bp,编码480个氨基酸。qRT-PCR结果分析表明:UDPGDH基因的表达量在落叶松杂交子代中远远高于亲本,正交子代的表达比反交子代高,说明UDPGDH在形成细胞壁半纤维素前体物过程中起着非常重要的作用,暗示UDPGDH在子代的高表达有利于杂种优势的形成。
- 日本落叶松
- / 尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶
- / cDNA克隆
- / 表达分析
Abstract: Based on the data of Japanese larch Solexa transcriptome sequencing obtained by splicing uridine diphosphate glucose dehydrogenase (UDPGDH) of the original sequence, the sequence ends with primers designed in parental and offspring young larch needles leaves, the cDNA sequence of UDPGDH gene was successfully cloned. Sequence analysis showed that the gene contained an open reading frame (GenBank No.KF499528) of 1 443 bp encoding a putative protein o f 480 amino acids. The expression of parental and offspring UDPGDH gene was analyzed by qRT-PCR. Offspring has a much higher expression compare with their parents' and orthogonal offspring UDPGDH gene express higher than the reciprocal cross progeny. UDP-glucose dehydrogenase is an important enzyme in the formation of hemicellulose and pectin, the components of newly formed cell walls. It might support that UDPGDH gene's high expression is beneficial to the heterosis of offspring.
- Larix kaempferi
- / uridine diphosphate glucose dehydrogenase
- / cDNA cloning
- / expression analysis

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日本落叶松 UDPGDH基因的cDNA克隆和表达分析

1. 南开大学生命科学学院, 天津 300071

收稿日期: 2013-08-21

基金项目: 国家"973"计划项目(2009CB119105)

关键词:

摘要: 以日本落叶松杂交Solexa转录组测序获得的数据为依据,经拼接后获得尿苷二磷酸葡萄糖脱氢酶(UDPGDH)原序列,以该序列两端设计引物,在落叶松亲代和子代幼嫩针叶中成功克隆了UDPGDH基因cDNA序列,序列长1 443 bp,编码480个氨基酸。qRT-PCR结果分析表明:UDPGDH基因的表达量在落叶松杂交子代中远远高于亲本,正交子代的表达比反交子代高,说明UDPGDH在形成细胞壁半纤维素前体物过程中起着非常重要的作用,暗示UDPGDH在子代的高表达有利于杂种优势的形成。