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核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

周贝贝 文明 马庆国 裴东

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核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

  • 基金项目:

    国家自然科学基金项目(31171933)

  • 中图分类号: S718.46

Analysis of Genomic DNA Methylation Modification of Walnut by Methylation-sensitive Amplification Polymorphism

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 以‘中宁强’核桃品种成熟叶片为材料,采用优化的 MSAP 反应体系,在全基因组水平对核DNA 进行甲基化修饰位点分析,结果表明:选用20对引物组合,共扩增出1 060条清晰、重复性好的谱带,平均每对引物扩增出53条谱带,其中,甲基化位点241个,甲基化修饰比例为22.73%. 对部分核桃 DNA 甲基化修饰位点进行回收测序,得到10条存在 DNA 甲基化修饰的 DNA 序列,BLASTn分析表明,核桃基因组中多种类型的DNA序列存在甲基化修饰现象.
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出版历程
  • 收稿日期:  2013-12-22

核桃基因组DNA甲基化修饰位点的MSAP分析

  • 1. 中国林业科学研究院林业研究所, 林木遗传育种国家重点实验室, 北京 100091
  • 2. 凉山州林业局, 四川 凉山 615500
基金项目:  国家自然科学基金项目(31171933)

摘要: 以‘中宁强’核桃品种成熟叶片为材料,采用优化的 MSAP 反应体系,在全基因组水平对核DNA 进行甲基化修饰位点分析,结果表明:选用20对引物组合,共扩增出1 060条清晰、重复性好的谱带,平均每对引物扩增出53条谱带,其中,甲基化位点241个,甲基化修饰比例为22.73%. 对部分核桃 DNA 甲基化修饰位点进行回收测序,得到10条存在 DNA 甲基化修饰的 DNA 序列,BLASTn分析表明,核桃基因组中多种类型的DNA序列存在甲基化修饰现象.

English Abstract

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