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基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定

李旦 周安佩 张德国 高健 何承忠 李永和

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基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定

  • 基金项目:

    国家自然科学基金项目(31360156)、云南省科技厅项目(2008PY021)、西南林业大学校级科研启动基金资助项目

  • 中图分类号: S718.46

Identification of Rosa sterilis Based on AFLP Molecular Markers and DNA Barcodes

  • CLC number: S718.46

  • 摘要: 利用AFLP分子标记和DNA条形码技术,对采自贵州省兴仁县和贵州省安顺市的刺梨、无籽刺梨和光枝无籽刺梨共19份样本材料进行鉴定。结果表明:AFLP标记分析19个样本间的遗传相似系数在0.719 0 0.997 2之间,平均相似系数为0.936 5。采用UPGMA 法进行聚类分析,将19个样本聚类为2组,刺梨为单独1组,其他18份样本为1组。DNA条形码分析结果显示ITS无变异位点,将4种叶绿体序列片段(psbA-trnH、atpF-atpH、psbI-psbK、trnL-F)合并后以联合序列作为数据分析的基础,19份样本的平均误差为0.000 6,除刺梨外,其他18份样本之间的遗传距离均为0,而刺梨与无籽刺梨、光枝无籽刺梨之间的遗传距离均为0.005 8。两种方法的鉴定结果一致,无籽刺梨与刺梨是独立的2个种,兴仁县无籽刺梨与安顺市的光枝无籽刺梨为同一个种。本研究结果明确了无籽刺梨的系统地位,从分子水平和基因水平上解决无籽刺梨的分类分歧,为今后开展无籽刺梨种质资源的收集、保存、开发和应用等奠定了理论基础。
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出版历程
  • 收稿日期:  2014-07-21

基于AFLP分子标记和DNA条形码对无籽刺梨的鉴定

  • 1. 西南林业大学, 云南 昆明 650224
  • 2. 云南生物多样性研究院, 云南 昆明 650224
  • 3. 贵州兴仁县石漠化综合治理领导小组办公室, 贵州 兴仁 562300
基金项目:  国家自然科学基金项目(31360156)、云南省科技厅项目(2008PY021)、西南林业大学校级科研启动基金资助项目

摘要: 利用AFLP分子标记和DNA条形码技术,对采自贵州省兴仁县和贵州省安顺市的刺梨、无籽刺梨和光枝无籽刺梨共19份样本材料进行鉴定。结果表明:AFLP标记分析19个样本间的遗传相似系数在0.719 0 0.997 2之间,平均相似系数为0.936 5。采用UPGMA 法进行聚类分析,将19个样本聚类为2组,刺梨为单独1组,其他18份样本为1组。DNA条形码分析结果显示ITS无变异位点,将4种叶绿体序列片段(psbA-trnH、atpF-atpH、psbI-psbK、trnL-F)合并后以联合序列作为数据分析的基础,19份样本的平均误差为0.000 6,除刺梨外,其他18份样本之间的遗传距离均为0,而刺梨与无籽刺梨、光枝无籽刺梨之间的遗传距离均为0.005 8。两种方法的鉴定结果一致,无籽刺梨与刺梨是独立的2个种,兴仁县无籽刺梨与安顺市的光枝无籽刺梨为同一个种。本研究结果明确了无籽刺梨的系统地位,从分子水平和基因水平上解决无籽刺梨的分类分歧,为今后开展无籽刺梨种质资源的收集、保存、开发和应用等奠定了理论基础。

English Abstract

参考文献 (35)

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